Etude taxonomique des souches de Streptomyces isolées des sols Sahariens

Abstract

Notre étude a pour objectif l’identification morphologique et moléculaire des deux souches d’actinobactéries baptisées G61 et B31 isolés à partir des sols sahariens. Les résultats obtenus après l’étude morphologique nous ont permis d’affilier les deux isolats au genre Streptomyces. En effet, ces résultats ont montré que les deux isolats G61 et B31 ont une bonne croissance presque sur tous les milieux de culture utilisés et ayant des mycéliums aériens portant des chaines de spores de type RA et S successivement. Ces caractéristiques morphologiques sont les traits typiques du genre Streptomyces. L’étude phylogénétique effectuée consiste à comparer les séquences d’ADNr 16S des deux isolats obtenus après PCR et séquençage avec celles des espèces contenues dans la banque génomique à l’aide du programme de BLAST et du logiciel MEGA-X 10.2. Les analyses de similitude par BLAST et les arbres phylogéniques construits ont confirmé l’appartenance des isolats au genre Streptomyces et ont déterminé que : l’isolat G61 est plus proche des deux espèces Streptomyces lutues et Streptomyces mutabilis avec le même pourcentage de similarité 100%. Tandis que, l’isolat B31 est plus proche de l’espèce Streptomyces alfalfae avec un taux de similarité 100%. Malgré le haut degré de similitude obtenu, une hybridation ADN/ADN avec les espèces les plus proches est demandée pour une identification finale.